MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 1444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012855	TCC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012855	GCG	2	6	41	46	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012855	CGT	2	6	58	63	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012855	AT	3	6	169	174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012855	CTG	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012855	TGCA	2	8	2399	2406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012855	GGCG	2	8	2420	2427	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012855	T	6	6	4522	4527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012855	CTC	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012855	TGAG	2	8	4905	4912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012855	AC	3	6	5009	5014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012855	TC	3	6	5032	5037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012855	CCCG	2	8	5091	5098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_012855	AG	3	6	5160	5165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012855	GTGA	2	8	9162	9169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012855	TGA	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012855	TTG	2	6	9188	9193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012855	GA	3	6	9245	9250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012855	CTT	3	9	9258	9266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012855	TGG	2	6	9271	9276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012855	GCGA	2	8	9291	9298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012855	CTAG	2	8	9376	9383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012855	GC	3	6	9446	9451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012855	CG	3	6	9460	9465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012855	TGCG	2	8	9501	9508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012855	TC	3	6	9549	9554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012855	TTTC	2	8	9574	9581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012855	CGA	2	6	9652	9657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012855	CCA	2	6	10701	10706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012855	TCAA	2	8	10792	10799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012855	GGT	2	6	10943	10948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012855	TCC	2	6	11066	11071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_012855	CGG	2	6	11108	11113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012855	TCCC	2	8	11149	11156	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_012855	TGT	2	6	11192	11197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012855	CGA	2	6	12219	12224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012855	A	6	6	12232	12237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012855	AAG	2	6	12279	12284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012855	TCG	2	6	12313	12318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012855	GT	3	6	12563	12568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012855	GAC	2	6	12582	12587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012855	A	7	7	12589	12595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012855	CGG	2	6	12634	12639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012855	CGAG	3	12	12690	12701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012855	TTG	2	6	12728	12733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012855	GGCC	2	8	12797	12804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012855	CAA	2	6	12822	12827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012855	GC	3	6	12831	12836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012855	GGC	2	6	12880	12885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012855	GC	3	6	12884	12889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012855	A	6	6	13013	13018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012855	G	8	8	13842	13849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012855	TTC	2	6	13857	13862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012855	TCA	2	6	13872	13877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012855	TCG	2	6	13901	13906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012855	CT	3	6	13917	13922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012855	AAG	2	6	13940	13945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012855	T	7	7	13947	13953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012855	TCT	2	6	14002	14007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012855	GA	3	6	14014	14019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012855	TTC	2	6	14065	14070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012855	GGCC	2	8	14107	14114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012855	AGG	2	6	14156	14161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012855	T	7	7	15274	15280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012855	G	6	6	15322	15327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012855	CGAGG	2	10	15388	15397	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012855	CCT	2	6	15431	15436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012855	GTC	2	6	15504	15509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012855	TCA	2	6	15530	15535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012855	GCC	2	6	15544	15549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012855	CCA	2	6	15582	15587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012855	GATG	2	8	15600	15607	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012855	CAG	2	6	15616	15621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012855	TCG	2	6	15632	15637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012855	AGCA	2	8	15638	15645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012855	CAG	2	6	15720	15725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012855	GGCGA	2	10	15802	15811	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012855	CGG	2	6	16016	16021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012855	AC	3	6	16306	16311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012855	GGC	2	6	16372	16377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012855	GCC	2	6	17593	17598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012855	ACCC	2	8	17643	17650	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_012855	ACCT	2	8	20027	20034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012855	GCT	2	6	20322	20327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012855	CGGG	2	8	20353	20360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012855	CAG	2	6	20389	20394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012855	GAG	2	6	20395	20400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012855	GCC	2	6	20406	20411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012855	C	8	8	20410	20417	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_012855	CGG	2	6	20560	20565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012855	ACG	2	6	20574	20579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012855	TCAG	2	8	20677	20684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012855	TGA	2	6	20741	20746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012855	GGA	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012855	TCCC	2	8	20930	20937	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_012855	TGA	2	6	20951	20956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012855	AGA	2	6	21086	21091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012855	TCT	2	6	21171	21176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012855	A	7	7	21239	21245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012855	GGC	2	6	21270	21275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012855	TGG	2	6	21332	21337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012855	GCC	2	6	21351	21356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_012855	CAA	2	6	21359	21364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012855	TAG	2	6	21371	21376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012855	AATC	2	8	21402	21409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012855	CTT	2	6	21416	21421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012855	TTG	2	6	21432	21437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012855	TGCC	2	8	21455	21462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012855	TGC	2	6	21493	21498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012855	CATG	2	8	21504	21511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012855	TTTA	2	8	21522	21529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012855	TAT	2	6	21547	21552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012855	ATTT	2	8	21556	21563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012855	AAT	2	6	21569	21574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012855	GC	3	6	21624	21629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012855	TCA	2	6	21829	21834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012855	AGG	2	6	21871	21876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012855	GC	3	6	24843	24848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012855	AC	3	6	24915	24920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012855	CGCA	2	8	25010	25017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012855	CA	4	8	25054	25061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012855	GCC	2	6	25173	25178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012855	ATG	2	6	25243	25248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012855	ATTTG	2	10	25313	25322	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012855	T	6	6	25328	25333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012855	GGA	2	6	25335	25340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012855	AC	3	6	25423	25428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012855	TG	3	6	25447	25452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012855	CTT	2	6	25494	25499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012855	TAC	2	6	27351	27356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012855	GCC	2	6	28104	28109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012855	CGG	2	6	28236	28241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012855	TGA	2	6	28242	28247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012855	CTC	2	6	28446	28451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_012855	GGAA	2	8	28452	28459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012855	AGC	2	6	28501	28506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012855	CGG	2	6	28524	28529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012855	GA	3	6	28539	28544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012855	CAT	2	6	28600	28605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012855	TTC	2	6	28670	28675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012855	GCC	2	6	28711	28716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_012855	GC	4	8	28845	28852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012855	GCT	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012855	GCT	2	6	28932	28937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012855	ACA	2	6	28999	29004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012855	T	8	8	29009	29016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012855	CAC	2	6	31843	31848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_012855	GCC	2	6	31859	31864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_012855	AGC	2	6	31876	31881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012855	GC	3	6	31885	31890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012855	GCC	2	6	31930	31935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_012855	CA	3	6	31958	31963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_012855	CGT	2	6	31973	31978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_012855	CAC	2	6	32122	32127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_012855	CGT	2	6	32157	32162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_012855	CGC	2	6	32179	32184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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161	NC_012855	GC	3	6	32196	32201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_012855	CCA	2	6	33956	33961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_012855	CGC	2	6	33977	33982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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173	NC_012855	CG	3	6	39650	39655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_012855	CGT	2	6	43011	43016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_012855	CAGA	2	8	43068	43075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_012855	GCA	2	6	43441	43446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_012855	AAG	2	6	45953	45958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_012855	TGACC	2	10	46017	46026	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_012855	GTC	2	6	46076	46081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_012855	CTG	2	6	46238	46243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_012855	CCAT	2	8	59766	59773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_012855	AGG	2	6	59903	59908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_012855	CTC	2	6	116902	116907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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432	NC_012855	TGCA	2	8	117050	117057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
433	NC_012855	GGT	2	6	120294	120299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012855	AGC	2	6	120360	120365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_012855	ATC	2	6	120395	120400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_012855	CAC	2	6	120549	120554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
437	NC_012855	AT	3	6	120592	120597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_012855	AC	3	6	121204	121209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
439	NC_012855	ACC	2	6	121218	121223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
440	NC_012855	TGC	2	6	122281	122286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_012855	ACG	2	6	122292	122297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_012855	GCC	2	6	122874	122879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_012855	CGCAG	2	10	122895	122904	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
444	NC_012855	GCG	2	6	123257	123262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_012855	GC	3	6	125312	125317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
446	NC_012855	CAT	2	6	126232	126237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_012855	C	6	6	126428	126433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
449	NC_012855	GAG	2	6	126436	126441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
450	NC_012855	TTC	2	6	126505	126510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_012855	CG	3	6	126550	126555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
452	NC_012855	TGG	2	6	126661	126666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_012855	TGC	2	6	126700	126705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_012855	GTT	2	6	126742	126747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_012855	ACC	2	6	126789	126794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_012855	TGG	2	6	126820	126825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
457	NC_012855	ATGCA	2	10	126833	126842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
458	NC_012855	GGC	2	6	126959	126964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_012855	TGG	2	6	127617	127622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
460	NC_012855	ACC	2	6	127625	127630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
461	NC_012855	GGC	2	6	127632	127637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_012855	GGC	2	6	128098	128103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_012855	GAG	2	6	129743	129748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_012855	AAC	2	6	130933	130938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_012855	GCC	2	6	131468	131473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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483	NC_012855	GGC	2	6	132982	132987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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